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細(xì)菌生物多樣性促進“噬菌體耐受性”定向進化

更新時間:2021-08-02點擊次數(shù):1057

新的研究表明,在自然環(huán)境中(非實驗室條件下)細(xì)菌可以通過演化產(chǎn)生對噬菌體感染的抵抗力。


來自Exeter大學(xué)的研究者們調(diào)查了為什么銅綠假單胞菌在實驗室和自然界中會以不同的方式產(chǎn)生對噬菌體的抗性。在實驗室中,細(xì)菌的突變往往會導(dǎo)致噬菌體感染所依賴的附著受體的缺陷。而在自然環(huán)境中,細(xì)菌傾向于使用被稱為CRISPR-Cas的免疫機制產(chǎn)生抵抗力。

 

雖然該研究仍舊是在實驗室中進行的,但是通過將銅綠假單胞菌與其它類型的細(xì)菌混合培養(yǎng)用以模擬“自然條件",研究人員表明,這種額外的“生物復(fù)雜性"有助于平衡基于CRISPR的噬菌體耐受性。




研究者們發(fā)現(xiàn),與失去噬菌體受體的進化不同,這種基于CRISPR的噬菌體抗性不會降低細(xì)菌的毒力。

 

“當(dāng)我們引入生物多樣性時,細(xì)菌更偏向于基于CRISPR的進化,"該研究的主要作者Ellinor Alseth說:“在自然的環(huán)境中,失去表面受體(噬菌體所附著的)是有代價的,因為該分子對于細(xì)菌本身可能還具有其它功能。如果喪失這種表面受體,那么與其他種類的細(xì)菌相比,突變菌的競爭力將會變低,從而不適于生存。因此,在更復(fù)雜的,更'自然'的環(huán)境中,基于CRISPR的抗性受到細(xì)菌的青睞。"

 

“通過CRISPR進化途徑,細(xì)菌可以保持其毒性水平"。通過觀察細(xì)菌對蛾幼蟲(Galleria mellonella)的作用,作者證實了這一觀點,研究人員認(rèn)為,這種作用會對人類產(chǎn)生類似的效果。目前銅綠假單胞菌在包括醫(yī)院在內(nèi)的各種不同環(huán)境中都能繁衍生息。它經(jīng)常在囊性纖維化患者的肺部定植,這也是上述患者發(fā)病和死亡的主要原因。

 

研究結(jié)果表明,細(xì)菌-噬菌體相互作用的進化結(jié)果可以從根本上改變微生物群落的環(huán)境。傳統(tǒng)上,這種相互作用是孤立地研究的,但是研究人員認(rèn)為,其他微生物的復(fù)雜混合物的存在可能對“傳染病的進化流行病學(xué)具有關(guān)鍵意義"。

資訊出處:Evolving alongside other bacteria keeps hospital bug potent
原始出處:Ellinor O. Alseth, Elizabeth Pursey, Adela M. Luján, Isobel McLeod, Clare Rollie & Edze R. Westra. Bacterial biodiversity drives the evolution of CRISPR-based phage resistance. Nature, 2019 DOI: 10.1038/s41586-019-1662-9



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